英联船厂是由祥生船厂、耶松船厂、瑞镕船厂、万隆铁工厂、和丰船坞、董家渡船坞等厂坞经过多次兼并和合并而成的。清同治元年（1862年），英商尼柯逊、包义德在上海浦东陆家嘴开设祥生船厂，建厂初期制造军火，后来修造船舶，曾为清政府建造过2艘浮江炮艇及其他船舶。19世纪70年代，祥生船厂兼并了虹口的新船坞及浦东炼铁机器厂，并于光绪十七年（1891年）改组为股份有限公司。耶松船厂是英商伟南于同治四年所建，位于虹口外虹桥，其规模比祥生船厂大，曾兼并过几家小厂，光绪十八年改组为股份有限公司，光绪二十六年又收购浦东陶家宅的和丰船坞和发昌机器厂。光绪二十七年祥生、耶松两厂合并，组成耶松船厂公司。两厂合并后实力大增，拥有6个大船坞，资本猛增至557万两白银。光绪三十一年，公司整顿财务，重新注册，改名耶松有限公司。
瑞镕船厂系德商企业，建于光绪二十六年，光绪二十九年开挖船坞，专造浅水船、拖船、驳船和游览船。光绪三十年德商万隆铁工厂成立，从事造船及海船修理业务。民国元年（1912年）瑞镕兼并了万隆铁工厂，统称瑞镕船厂。第一次世界大战德国战败，瑞镕厂主转入英国籍，船厂也成了英商企业。英商企业为了避免自相倾轧，决定联合起来，于民国25年正式签约合并，成立英联船厂股份有限公司（简称英联船厂）。合并后共占地30万平方米，职工近1000人，拥有4座大型船坞（杨树浦1号、2号船坞，董家渡船坞及和丰船坞）。民国21～30年，英联船厂及瑞镕船厂共承修中外舰船2248艘，其中包括英国军舰64艘、美国军舰21艘、日本军舰31艘、意大利军舰1艘，营业状况甚佳。
太平洋战争爆发后，日军接管英联船厂，其杨树浦总厂改称三菱株式会社江南造船所杨树浦工场。民国31～34年8月共修理舰船382艘，几乎全是日本的军舰。抗日战争胜利后，国民政府海军部接管英联船厂，民国34年9月16日归还英商，并恢复原来的厂名。
上海船厂的另一个源头是招商局机器造船厂，创建于民国3年。是年，招商局为扩大营业，把“招收民股”改为“官督商办”，并拨款37600余两白银，在浦东陆家嘴租地7亩，创办了招商局内河机厂，当时约有职工100人。民国17年，改名招商局机器造船厂。民国25年，奉命将机器、设备、材料迁至招商局汉口分局四号仓库装置开业。抗日战争爆发后，几经变迁，直至民国28年在重庆龙门浩设厂，改名国营招商局机器厂，有职工约200人。抗日战争胜利后，招商局迁回上海，工厂人员返沪，并接收闸北潘家湾内河造船厂、南市机厂街中央造船厂（前身为民办合兴机器制造厂）和浦东泰同栈黄浦造船所等3个小修理厂，分别改名国营招商局第一、第二、第三船舶修理所。民国36年10月，招商局将第一、第二两个修理所合并迁至浦东泰同栈第三船舶修理所，并改名国营招商局机器造船厂。
1949年5月29日，上海市军事管制委员会航运管理处接管招商局机器造船厂，改名为招商局轮船股份有限公司船舶修造厂。当时全厂有职工699人，工厂总面积7.6万平方米，岸线413米，金属切削机床129台，锻压设备21台，焊接设备36台，厂房建筑面积3300余平方米。1951年11月，工厂改名为中央人民政府交通部海运管理总局上海船舶修造厂。