为了正确组织水运生产，及时、迅速、有效地解决生产中发生的问题，需要建立和健全水运生产和港口生产调度指挥系统。在交通部总调度室业务领导和指导，港航企业应分别成立生产调度室，形成一个上下相互联系的、迅速传递信息的生产调度指挥系统，分工负责完成各自的任务。
港口生产调度指挥系统的主要职责是，在局长或经理的领导下，负责全港日常装卸生产的组织指挥工作。主要工作内容有：
1．根据上级主管部门下达的运输任务，审核平衡港口各作业区（或装卸公司）的吞吐量计划，具体编制月度、旬度和昼夜生产作业计划，并组织全面完成计划任务。
2．按照装卸工艺方案，合理利用劳力、机械、泊位、库场及其他设备，充分发挥和扩大港口通过能力，努力缩短车船停港时间。
3．根据货流、货种、车船到港变化情况，平衡调整各作业区的作业安排，组织均衡生产，保证船舶作业安全，提高货运质量。
4．掌握车船装卸进度和货物集中情况，联系铁路、航运和物资部门，搞好车、船和衔接。
5．编制保专线、班轮、成租、集装箱、特运、成套设备和长重大件为重点的装卸方案，并组织实施。
6．检查安全生产及客货运输质量，分析存在的问题，提出改进措施。
7．负责联系有关运输船舶的燃物料、淡水、伙食等项供应和船舶临时修理工作（船籍港除外）。
8．负责各调度会议汇报安全、生产、客货运输质量情况和存在的问题，监督检查生产决议的执行情况。
9．负责日常生产快速统计和生产日报编制工作。
10．按旬、月作出调度工作小结，总结推广先进经验，不断提高调度工作水平。
11．组织合理运输，按计划组织货物集中和疏运、合理使用场库，努力扩大场库通过能力。
12．有外轮装卸任务的港口，每天将旬计划内的外贸船舶靠泊、装卸和预计离港日间的动态报告各外轮分公司。
以上各项的工作需要有一系列的工作制度来保证，调动工作制度主要有：值班制度、会议制度、记录制度、汇报制度、调度统计与分析制度。
港口调度主要是工人、锚位、泊位、装卸机械、运输机械等资源的配置。
比如一艘船要进港，但暂时没有泊位空闲，就需要先在港外的锚地锚泊，这时指挥中心调度工作人员，工作人员调度船舶在恰当的锚位锚泊；当有泊位空闲，工作人员（或工作船）引航船舶进港靠泊，然后调度一定的装卸机械（如装卸桥）到船舶靠泊的泊位处装卸货物，陆域堆场则需调度运输机械（如叉车、集卡）运输货物，以便协调装卸船。
参考资料： 航运在线