舰岛相当于航母的中枢神经系统，实在是太太太重要了。所以如题主所说，如果作战时舰岛被击中，那么航母就很有可能会陷入瘫痪。
航母的舰岛一般布置在甲板右侧，即Starboard Side（日本二战时也曾经有少数左置舰岛的航母），集成了舰桥和烟囱，如果是核航母就只是舰岛。舰岛设置有多层舰桥，包含飞行控制舰桥（Primary Flight Bridge），航海舰桥（Bridge）和司令舰桥（Flag Bridge），此外还有航空甲板控制室。舰岛上方设置有主雷达、桅杆和通信导航天线等。
以尼米兹级航母为例，舰岛设置了四层舰桥，上面一层为飞行控制，中层为航行控制，下层是作战指挥和信息处理，在舰岛侧面最下一层舰桥朝向侧面，设置了航空甲板控制室
如果一枚导弹如果命中了司令舰桥，假如此时舰队司令恰好呆在这里，那就会直接阵亡，如果这样那可能整个舰队都会陷入混乱。考虑到这个严重问题，一般航母都会把CIC（作战情报室）挪到船身内部。所以CIC一般给人的印象都是黑灯瞎火的，只看到屏幕很亮，就是因为它是在船身里的。而司令官在作战时可以选择呆在CIC盯着终端显示屏来指挥作战。
尼米兹级的CIC，总是黑灯瞎火的，因为它位于甲板下方
伊丽莎白女王级的CIC
即便是只摧毁了航海舰桥，也会造成船长和舵手阵亡和操纵设施和导航设施毁坏，造成航母无法正常航行；而如果是飞行控制舰桥或者甲板控制室被摧毁，会造成甲板上的飞机无法调度，或者调度效率下降，也会严重影响航母战斗力发挥。
当然了，具体每个国家的航母舰岛设计都不一样，有大有小，甚至还有双舰岛设计的。但是总体而言舰岛的职能不会有变化。比如英国的伊丽莎白女王级用了两个舰岛，实际上是把航海和飞行控制、作战指挥分开了，总的职能和其他单舰岛航母是一样的。
辽宁号和库兹涅佐夫号姊妹舰，来自于苏联的1143.5和1143.6图纸，都采用了硕大的舰岛设计，除去本身设计理念的问题，也和集成了烟囱有关系
尼米兹级的舰岛，最下层建筑占地面积较小，上层舰桥外飘。美国的核航母没有烟囱，作战舱室少，所以舰岛做的很小。
伊丽莎白女王级的双舰岛，一个负责航海，一个负责飞行控制和作战指挥
下面以多个国家的航母来举例，我们来看看舰岛上具体包含哪些设施和具体的作用。
雷达天线下图是福特级的舰岛，硕大的两个矩形的AESA雷达用于对空搜索，舰岛上桅杆上的各种雷达罩内是通信、导航、敌我识别、ECCM电子作战系统。所以说舰岛是全舰的电磁信号的收发和处理中心。
飞行控制舰桥飞行控制室是用来进行飞行控制的，类似民航机场的空中交通管制室。同时通过目视来指挥8km范围内以及甲板上的舰载机何时起飞，降落。由于对视野的要求比较高，一般置于舰岛的最上层。
杜鲁门号航母上的飞行控制舰桥
飞行控制舰桥和民航机场的地面塔台是一个作用
航海舰桥主要是观察海况，指挥航母的行驶、转向用的。包括船长和舵手。
戴高乐号的作战航海舰桥内的控制平台
我国辽宁号航海舰桥内的女舵手
西奥多罗斯福号航母的舵手
维克拉玛蒂亚号指航海舰桥内的舵手位
司令舰桥作战时舰队司令会直接坐镇在这里，进行作战指挥，在这里可以直接站在其舰桥通过望远镜进行目视观测，而且同样有显控平台供司令官使用。
林肯号航母穿越霍尔木兹海峡期间，司令舰桥内的值班人员
当然司令也可以选择甲板下方的CIC作战情报室，因为这里有更厚装甲的保护，而且雷达、通信的情报共享都在这里，方便作出判断和下达命令。高烈度战争下，舰队司令还是呆在这里比较好。
里根号航母剖面，CIC位于甲板下方（绿色方框圈出）
飞行甲板控制室飞行甲板控制室位于舰岛侧面，主要是用来监控甲板当前飞机的排列布置情况和作业状态，利用一个航母微缩模型通过摆放飞机模型来进行甲板实时情况展现。舰载机何时从机库上升降机，何时起飞，都必须由飞行甲板控制室进行统一调度。
飞行甲板控制室，空间不大，但是对战斗力的发挥是个关键