以下回答来自于北京诚力财务代理
建议参看国家税务局发布的《营业税改征增值税试点地区适用增值税零税率应税服务免抵退税管理办法(暂行)》的公告，有比较详细的说明
零税率应税服务提供者在申报办理零税率应税服务免抵退税前，应向主管税务机关办理出口退（免）税认定。办理出口退（免）税认定时，应提供以下资料：
1.银行开户许可证；
2.从事水路国际运输的应提供《国际船舶运输经营许可证》；从事航空国际运输的应提供《公共航空运输企业经营许可证》，且其经营范围应包括“国际航空客货邮运输业务”；从事陆路国际运输的应提供《道路运输经营许可证》和《国际汽车运输行车许可证》，且《道路运输经营许可证》的经营范围应包括“国际运输”；从事对外提供研发设计服务的应提供《技术出口合同登记证》。
零税率应税服务提供者在营业税改征增值税试点后提供的零税率应税服务，如发生在办理出口退（免）税认定前，在办理出口退（免）税认定后，可按规定申报免抵退税。
船舶吨税的税额标准
吨税税目税率表（出自2011年《中华人民共和国船舶吨税暂行条例》） 税 目 （按船舶净吨位划分）税 率（元/净吨）备 注普通税率 （按执照期限划分）优惠税率 （按执照期限划分）1年90日30日1年90日30日不超过2000净吨 12.64.22.19.03.01.5拖船和非机动驳船分别按相同净吨位船舶税率的50%计征税款 超过2000净吨，但不超过10000净吨 24.08.04.017.45.82.9超过10000净吨，但不超过50000净吨 27.69.24.619.86.63.3超过50000净吨 31.810.65.322.87.63.8 2011年《中华人民共和国船舶吨税暂行条例》规定，应税船舶负责人应当自海关填发吨税缴款凭证之日起15日内向指定银行缴清税款。未按期缴清税款的，自滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款0.5‰的滞纳金。
海关发现少征或者漏征税款的，应当自应税船舶应当缴纳税款之日起1年内，补征税款。但因应税船舶违反规定造成少征或者漏征税款的，海关可以自应当缴纳税款之日起3年内追征税款，并自应当缴纳税款之日起按日加征少征或者漏征税款0.5‰的滞纳金。
海关发现多征税款的，应当立即通知应税船舶办理退还手续，并加算银行同期活期存款利息。
应税船舶发现多缴税款的，可以自缴纳税款之日起1年内以书面形式要求海关退还多缴的税款并加算银行同期活期存款利息；海关应当自受理退税申请之日起30日内查实并通知应税船舶办理退还手续。
应税船舶应当自收到本条第二款、第三款规定的通知之日起3个月内办理有关退还手续。
应税船舶有下列行为之一的，由海关责令限期改正，处2000元以上3万元以下罚款；不缴或者少缴应纳税款的，处不缴或者少缴税款50%以上5倍以下的罚款，但罚款不得低于2000元： （一）未按照规定申报纳税、领取吨税执照的； （二）未按照规定交验吨税执照及其他证明文件的。