法律依据国家质检总局的《食品标识管理规定》，规定转基因食品或者含法定转基因原料的产品，必须在标识上加入中文说明。另一个是国务院的《农业转基因生物安全管理条例》，规定“列入农业转基因生物目录”的农产品，必须有明显标识。
国家对农业转基因生物实行标识制度。实施标识管理的农业转基因生物目录，由国务院农业行政主管部门商国务院有关部门制定、调整和公布。凡是列入标识管理目录并用于销售的农业转基因生物，应当进行标识；未标识和不按规定标识的，不得进口或销售。 标识标注方法转基因标识不合规范（一）转基因动植物（含种子、种畜禽、水产苗种）和微生物，转基因动植物、微生物产品，含有转基因动植物、微生物或者其产品成份的种子、种畜禽、水产苗种、农药、兽药、肥料和添加剂等产品，直接标注“转基因××”。
（二）转基因农产品的直接加工品，标注为“转基因××加工品（制成品）”或者“加工原料为转基因××”。（三）用农业转基因生物或用含有农业转基因生物成份的产品加工制成的产品，但最终销售产品中已不再含有或检测不出转基因成份的产品，标注为“本产品为转基因××加工制成，但本产品中已不再含有转基因成份”或者标注为“本产品加工原料中有转基因××，但本产品中已不再含有转基因成份”。
标识标注要求农业转基因生物标识应当醒目，并和产品的包装、标签同时设计和印制。难以在原有包装、标签上标注农业转基因生物标识的，可采用在原有包装、标签的基础上附加转基因生物标识的办法进行标注，但附加标识应当牢固、持久。
第一批实施标识管理的农业转基因生物目录1、大豆种子、大豆、大豆粉、大豆油、豆粕2、玉米种子、玉米、玉米油、玉米粉（含税号为11022000、11031300、11042300的玉米粉）3、油菜种子、油菜籽、油菜籽油、油菜籽粕4、棉花种子5、番茄种子、鲜番茄、番茄酱 实施乱象中国实行相对严格的转基因标识制度，但有的食品含有转基因成分却未明确标识，转基因食品的标识混乱，部分市售转基因食品并未明确标识。
不少市面销售的转基因食品存在标识不清的情况，部分使用转基因原材料加工制成的食品标识“羞答答”，有些甚至没有任何标识。市场上使用转基因原料的食用油的标识则隐蔽的多，在某品牌的一款食用调和油上，“加工原料为转基因大豆”，“加工原料为转基因油菜籽”的字样则“躲”在营养成分表上方以同样大小的黑色字体显示。
很多有经济能力的顾客出于安全角度考虑都会选择非转基因食品，这也就导致很多使用转基因原料的厂家把转基因标识能印多小印多小，最好是看不见才好。 。