第一条 为加强台湾船舶停泊点的管理，确保来靠台湾船舶的安全，方便台湾居民往来，促进闽台经济、文化交流，根据《中国公民往来台湾地区管理办法》以及有关法律、法规，结合本省实际，制定本办法。第二条 进入福建沿海的台湾船舶，应当在省人民政府批准的台湾船舶停泊点停泊（以下简称停泊点）。第三条 凡在停泊点停泊的台湾船舶及入出境的台湾居民，除法律、法规另有规定外，均应遵守本办法。第四条 台湾船舶因台风等不可抗力无法停靠停泊点的，可就近在避风点停泊，不可抗力解除，应当立即离港。第五条 台湾船舶及船上人员、货物、行李物品进出停泊点，由公安边防、海关等部门依法监管。
台湾船舶进入停泊点后，船长应当主动向公安边防执勤人员出示船舶证书、船员证书或其他有效证件，说明来靠原因及泊港时间，协助检查人员对船体、货物和行李物品进行检查。第六条 公安边防部门发现船上人员有下列情形之一的，不予批准上岸：
（一）无任何证件证明是台湾居民的；
（二）有等欺骗行为的；
（三）被遣送出境人员在不准入境期限内的；
（四）严重传染病患者和无人照料的精神病患者。第七条 台湾船舶泊港期间，船上人员应当遵守下列规定：
（一）不得擅自调整泊位；
（二）不得悬挂、显示有损于祖国统一的标志；
（三）不得擅自启用电台；
（四）不得向港内倾倒污物；
（五）不得携带危禁物品上岸；
（六）不得扰乱港口治安秩序和从事违法犯罪活动；
（七）不得擅自接大陆人员登船；
（八）船上必须留有足以保证安全的船员值班。第八条 台湾船舶泊港期间，海关等部门工作人员需要登船执行公务的，应事先通报当地公安边防部门；其他人员需办理有关手续后方可登船。
台湾船舶和台湾居民在停泊点发生事故或者险情的，停泊点所在地县级以上地方人民政府有关部门应当简化相关手续，并按照各自职责及时给予救援、帮助。第九条 台湾船舶、台湾居民泊港期间的事务，由有关部门、单位按照规定办理：
（一）避风、求医、探亲访友、洽谈投资、谒祖、旅游和修船、补给的，由停泊点所在地人民政府台湾事务办公室接待处理；
（二）从事小额贸易的，由停泊点所在地人民政府台湾事务办公室介绍给经省人民政府商务主管部门批准的对台贸易公司接洽；
（三）要求处理海事、渔事纠纷的，由停泊点所在地人民政府台湾事务办公室联系渔政、港监等部门处理；
（四）需要聘请短期渔工的，由停泊点所在地人民政府台湾事务办公室介绍给经省人民政府批准的有对台劳务合作经营权的公司接洽。
停泊点管理事务涉及多个部门的，由所在地人民政府台湾事务办公室负责协调。第十条 台湾居民需上岸的，应当持有效身份证件，向停泊点所在地公安边防部门申请办理《台湾居民登陆证》；持有《台湾居民来往大陆通行证》的，经公安边防部门登记后，不再办理《台湾居民登陆证》。第十一条 台湾居民应当在限定的范围内活动。
持《台湾居民登陆证》 的台湾居民，可在停泊点所在的县（市、区）范围内活动；持《台湾居民来往大陆通行证》 的台湾居民，可前往停泊点所在的县 （市、区） 以外地区从事探亲、旅游、投资、贸易等活动。第十二条 台湾居民应当在证件登记有效期内登船出境。
《台湾居民登陆证》 的登记有效期限不超过台湾船舶本航次停靠期限。台湾居民因特殊原因不能随原船出境或者需要延长居留期限的，应当在证件登记有效期内向上岸停泊点所在地县 （市、区） 人民政府台湾事务办公室提出申请。上岸停泊点所在地县（市、区）人民政府台湾事务办公室应当商公安边防部门审批。第十三条 台湾居民应当从原上岸停泊点乘原船出境。
因特殊原因需要改从本省其他停泊点或者改乘其他台湾船舶出境的，应当在证件登记有效期内向拟出境停泊点所在地县（市、区）人民政府台湾事务办公室提出申请。拟出境停泊点所在地县（市、区）人民政府台湾事务办公室应当商公安边防部门审批。第十四条 台湾居民遗失《台湾居民登陆证》《台湾居民来往大陆通行证》的，应当向原发证部门报失；经调查属实的，由原发证部门补发。